本作入围了今年的第11届手冢治虫文化奖，故事以架空设定的农学院为舞台，讲述一个东京农业大学的学生小文在学园里的日常生活。

　  出场人物有用肉眼可以看见细菌世界的主人公，与某日忽然消失在谜样的酒窖里的儿子，在学校的地基内制作发酵食品老教授，秘密造酒的先辈，女子院生和形形色色的细菌们，展开了搞笑的故事。
　
　  这次的动画中完全再现了原作里登场的100种以上细菌，一气呵成的热闹的细菌军团"酿"活动集结了CG技术的优势，描绘了非常壮烈的视觉效果。2D，3D，写实。。。

    作者石川雅之在《萌菌物语》面世前还创作过《日本政府直辖机动战队columnV》、《语部》（カタリベ）、《人斩龙马》等，属于默默无闻类型的作家。《萌菌物语》之所以被看重也是和近来专业大学类总品被关注有关，比如《交响情人梦》、《蜂蜜与四叶草》、《现视研》。不过这次的题材更偏向小众，故事以架空设定的农学院为舞台，讲述一个东京农业大学的学生小文在学园里的日常生活。但是他拥有可以看见常人看不见的“菌”的特异体质，而且能够听懂“菌语”。。。这种能力在小文所从事的领域简直可以称为“媲美3亿元电子显微镜的能力”，引起骚动也在情理之中。作者用平缓的笔触向我们展现了与我们人类共存的“菌世界”。

    本作清新可爱，搞笑的同时也轻松的介绍了很多科普知识，各种“菌”不仅造型超萌，而且有自己的思想，还可以说话，有的口气还十分狂妄：“小心我酿了你！”。实在是一部上乘的小品。本作入围了今年的第11届手冢治虫文化赏而引起关注，改编的同名动画已经完结。

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