小鱼儿（张卫健饰）和花无缺（谢霆锋饰）本是孪生兄弟，父亲江枫和移花宫的婢女花月奴私奔。就在花月奴产子时，单恋江枫的邀月宫主找到他们，把二人杀了。邀月养大其中一个婴儿花无缺，另一婴儿小鱼儿交江枫好友燕南天抚养，待十八年后，煽动两兄弟互相残杀，作为报复。燕南天抱着小鱼儿被仇家追杀，去到恶魔岛，便昏迷了！小鱼儿被岛上十大恶人（剧中只有五人）抚养成人。
　　十八年后，花无缺在移花宫长大，学得一身好功夫，俊朗不凡，对两位宫主唯命是从。相反，小鱼儿在恶魔岛长大，从十大恶人身上学到各式各样的整人技俩。岛上的鬼医常百草则专心医治燕南天，但医了十八年也未能把他治愈。
　　武林盟主铁如云突然失踪，江别鹤（王伯昭饰）在黄山召开武林大会，选新盟主。小鱼儿初闯江湖，上黄山查探自己的身世；花无缺则代两位师傅上黄山教训各大门派；铁如云的女儿铁心兰（范冰冰饰）亦赴黄山找父亲的下落。三人在黄山认识，成了好友，小鱼儿与铁心兰更结义为兄妹，无缺和心兰则一见钟情，互生情愫，奈何无缺早被邀月植入“断爱绝情丹”于体内，一动情便剧痛难当，故只好隐藏着自己的爱意。
　　一次，心兰中了邀月的碎心掌，小鱼儿只好混入慕容家偷取“火灵芝”来救心兰。小鱼儿因而跟慕容无敌的小女儿小仙女（柏雪饰）邂逅，小仙女虽生性野蛮，却与小鱼儿一见钟情，二人深爱对方。小鱼儿取得“火灵芝”治好铁心兰。
　　原来铁如云是被东厂头子刘喜掳去，困在死亡塔，他还插赃嫁祸，令皇上把慕容无敌一家抄家，掳去小仙女，练成「吸功大法」。小仙女死去，小鱼儿伤心欲绝，误闯毒王群英会，几乎被杀，幸得鬼医常百草之女苏樱（袁泉饰）所救。苏樱爱上小鱼儿，小鱼儿虽然对苏樱也有好感，但碍于对小仙女的思念，不敢再闯情关。此时，燕南天被常百草治愈，重出江湖，要为小鱼儿父亲复仇！
　　皇上要选妃，江别鹤把私生女儿江玉燕（杨雪饰）送入宫中做王妃，希望从此父凭女贵。江玉燕当了皇妃后，与父亲江别鹤合谋，铲除所有异己！
　　江玉燕一直对花无缺倾心，但花无缺却从来没有接受她的爱。他心中的至爱始终是铁心兰，他铲除体内的「断爱绝情丹」后，与心兰结为夫妇，心兰更为无缺生下孩子。玉燕得知此事，见到无缺与心兰母子幸福的样子，妒忌心起。
　　此时，江别鹤偷偷的吸掉刘喜的武功，成为武功天下第一的武林盟主。岂料江玉燕把江别鹤的武功尽数吸过来，她才是天下无敌！
　　她用计杀掉燕南天，嫁祸给花无缺；另一方面，她又杀掉铁心兰，嫁祸给小鱼儿，令小鱼儿和花无缺两兄弟因此而生死相搏，结果两败俱伤！
　　小鱼儿和花无缺得悉身世，揭穿江玉燕的阴谋，误会冰释，化敌为友，两兄弟合力对付江玉燕！花无缺先向苏樱取了剧毒服下，故意让玉燕吸功，使玉燕吸入剧毒，两人同归于尽。小鱼儿终于放下对小仙女的思忆，接受苏樱的爱，二人一起养育无缺和心兰的遗孤。
　　（说明：由于众所周知的原因，该剧对后半部分剧情做了大幅修改。江别鹤的戏份大幅减少，先被发往边关镇守，后被江玉燕害死草草收场。江玉燕最终做大，练成移花接木，吸取了邀月、怜星两位宫主的功力，无人能敌，铁心兰、燕南天皆丧命其手。东长督主刘喜投靠江玉燕，但被小鱼儿设计杀死。苏樱为助双骄报仇盗取剧毒之物午夜魔兰，不慎被其噬咬，毒发身亡。小鱼儿服下剧毒，故意让玉燕吸功而使其中毒，花无缺赶到，终于杀了仇人。小鱼儿尽管保住了性命，但由于真气尽失而骤然苍老。最后，花无缺携其子念鱼和小鱼儿一道归隐。）

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